Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms