Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms