Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AGAP6Q5VW22 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms