Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATRNL1Q5VV63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRNL1Q5VV63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms