Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGSNQ5TDP6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms