Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms