Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSL3PQ5NE16 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms