Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPDYCQ5MJ68 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYCQ5MJ68 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms