Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT1Q5JUK3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT1Q5JUK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms