Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHC2Q5JST6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms