Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMPK2Q5EBM0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK2Q5EBM0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms