Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 911.9 ms