Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms