Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSD17B12Q53GQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms