Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SBK1Q52WX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SBK1Q52WX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SBK1Q52WX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms