Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A12Q504Y0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A12Q504Y0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A12Q504Y0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms