Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4orf46Q504U0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms