Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO43Q4G163 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO43Q4G163 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms