Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP28Q4G0W2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DUSP28Q4G0W2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms