Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms