Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTLL9Q3SXZ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL9Q3SXZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms