Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUS10Q3MIT2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS10Q3MIT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS10Q3MIT2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms