Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NBPF1Q3BBV0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NBPF1Q3BBV0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NBPF1Q3BBV0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms