Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRFIP1Q32MZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRFIP1Q32MZ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms