Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HFEQ30201 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HFEQ30201 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HFEQ30201 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HFEQ30201 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HFEQ30201 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HFEQ30201 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HFEQ30201 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HFEQ30201 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms