Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTC1Q2NKJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTC1Q2NKJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms