Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QSER1Q2KHR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
QSER1Q2KHR3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
QSER1Q2KHR3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms