Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX7Q2KHR2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX7Q2KHR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX7Q2KHR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms