Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICBQ29980 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICBQ29980 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
MICBQ29980 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICBQ29980 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICBQ29980 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICBQ29980 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MICBQ29980 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MICBQ29980 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms