Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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