Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMN1Q16637 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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