Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STX1AQ16623 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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