Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA4Q16363 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA4Q16363 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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