Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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TAF11Q15544 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 348.3 ms