Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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