Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RYR3Q15413 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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