Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B3Q15393 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms