Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCF4Q15080 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCF4Q15080 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCF4Q15080 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCF4Q15080 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCF4Q15080 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCF4Q15080 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCF4Q15080 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCF4Q15080 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCF4Q15080 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCF4Q15080 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCF4Q15080 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCF4Q15080 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCF4Q15080 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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