Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAB3GAP1Q15042 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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