Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLINT1Q14677 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLINT1Q14677 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms