Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1DQ13901 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1DQ13901 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1DQ13901 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1DQ13901 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1DQ13901 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1DQ13901 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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