Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD4Q13485 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD4Q13485 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
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