Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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