Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SF3B2Q13435 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B2Q13435 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
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