Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3BPQ13352 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms