Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA1Q13136 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIA1Q13136 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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