Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF1Q12946 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF1Q12946 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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