Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN1Q12860 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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