Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C1Q12789 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms