Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YAL064WYAL064W 285 nt5.37□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 QCR2YPR191W 1107 nt5.37□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 PRM7YDL039C 2097 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YDR417CYDR417C 372 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 CAF16YFL028C 870 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 AIF1YNR074C 1137 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YOR342CYOR342C 960 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 NAT3YPR131C 588 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 ARG4YHR018C 1392 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 SIF2YBR103W 1608 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YDR444WYDR444W 2064 nt5.36□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 ESF1YDR365C 1887 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 IMD3YLR432W 1572 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 ZRC1YMR243C 1329 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 TIM21YGR033C 720 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 CLC1YGR167W 702 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 LAC1YKL008C 1257 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 ATG16YMR159C 453 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 HAT1YPL001W 1125 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YPR015CYPR015C 744 nt5.35□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 HUL4YJR036C 2679 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 SLM5YCR024C 1479 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 TED1YIL039W 1422 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 SPT3YDR392W 1014 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 CIA2YHR122W 696 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 MRT4YKL009W 711 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YLR365WYLR365W 333 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YOR062CYOR062C 807 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 RAD30YDR419W 1899 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 RTC1YOL138C 4026 nt5.34□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 RIT1YMR283C 1542 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 RSC6YCR052W 1452 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YER085CYER085C 522 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 DAN1YJR150C 897 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ECM9YKR004C 1134 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 GMH1YKR030W 822 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YBL036CYBL036C 774 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 KCC4YCL024W 3114 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 RAD7YJR052W 1698 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 CLN2YPL256C 1638 nt5.33□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ERG4YGL012W 1422 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 KIN28YDL108W 921 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 NUP42YDR192C 1293 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 BUD26YDR241W 288 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 PAN5YHR063C 1140 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 LNP1YHR192W 837 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YIL089WYIL089W 618 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ALB1YJL122W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 DID4YKL002W 699 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 MTR2YKL186C 555 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 SPC3YLR066W 555 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 OPY2YPR075C 1083 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YMR196WYMR196W 3267 nt5.32□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 APC1YNL172W 5247 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 SIR1YKR101W 1965 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 SAF1YBR280C 1914 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 MUP3YHL036W 1641 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 DOS2YDR068W 933 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 RPL28YGL103W 450 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ARG3YJL088W 1017 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YJR096WYJR096W 849 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YKR047WYKR047W 306 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 HEK2YBL032W 1146 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 APM2YHL019C 1818 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 GAS5YOL030W 1455 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 NNK1YKL171W 2787 nt5.31□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 KAR2YJL034W 2049 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 MAG2YLR427W 2013 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 PAL1YDR348C 1500 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YCR100CYCR100C 951 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ACT1YFL039C 1128 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 COG7YGL005C 840 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 TYW3YGL050W 822 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YLR374CYLR374C 390 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 BUB3YOR026W 1026 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 TRS33YOR115C 807 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ECM8YBR076W 1065 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YCL012CYCL012C 405 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 CAB3YKL088W 1716 nt5.3□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 MDM34YGL219C 1380 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YMR111CYMR111C 1389 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 TEC1YBR083W 1461 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 UBC5YDR059C 447 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YEL067CYEL067C 588 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 COS4YFL062W 1140 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ERG25YGR060W 930 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 YGR269WYGR269W 327 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 CCS1YMR038C 750 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 CUS2YNL286W 858 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 PDX3YBR035C 687 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 ATG14YBR128C 1035 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 Q0255Q0255 1419 nt5.29□□□□□ -1.56
CLF1Q12309 RGP1YDR137W 1992 nt5.29□□□□□ -1.56
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